Program Master of Ministry adalah program magister pelayanan Kristen berbasis e-learning dengan beban studi 12 mata kuliah atau 36 SKS, yang dirancang untuk memperlengkapi pendeta, pelayan gereja, pemimpin komunitas, pengajar, dan pekerja pelayanan Kristen agar bertumbuh dalam pemahaman Alkitab, teologi, formasi rohani, kepemimpinan, penggembalaan, pemuridan, misi, dan praktik pelayanan yang kontekstual. Melalui pembelajaran mandiri yang fleksibel, mahasiswa mempelajari bahan ajar, mengikuti kuis, mengerjakan tugas reflektif dan integratif, serta mengembangkan kemampuan untuk menghubungkan pengetahuan teologis dengan kebutuhan nyata gereja dan masyarakat. Program ini menekankan integrasi antara dasar biblika, kedewasaan rohani, keterampilan pelayanan, dan penerapan praktis, sehingga lulusan diharapkan mampu melayani dengan lebih matang, alkitabiah, efektif, dan relevan dalam konteks pelayanan masing-masing.